uds 13-14-07),
mais se retrouve à 413 reprises hors du réseau.
Cette non-prise en compte dans le réseau est dûe
à la recherche effectuée : une taille minimale de 5 blocs consécutifs sur le réseau.
Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire
Une grande partie de la base de données est comprise dans le réseau : que reste-t-il en dehors ?
En analysant les doublets non compris dans le réseau, deux principaux en ressortent: les paires bd
et fb. Les BPs situés aux extrémités
N- et C-terminales complétant ces paires
sont fortement variées.
Le triplet fbd est compris dans le réseau"
(partie droite du graphe avec les nuds 13-14-07),
mais se retrouve à 413 reprises hors du réseau.
Cette non-prise en compte dans le réseau est dûe
à la recherche effectuée : une taille minimale de 5 blocs consécutifs sur le réseau.
Il faut noter l'absence totale du bloc g qui est caractéristique de boucles de grandes tailles, plus variables. Il faudra donc noter que l'établissement d'un réseau prenant en compte un maximum de chemins a depuis été finalisé avec des chemins de fréquence plus faible, ainsi que l'utilisation de ces motifs répétés dans la prédiction de la structure à partir de la séquence.
(c) 2001- Alexandre de Brevern