Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire


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Extraction des mots et stabilité 3D

17 mots de tailles 4 à 7 BPs (i.e. 8 à 11 C$_{\alpha }$) ont été extraits du graphe, ils permettent de le recouvrir intégralement. Le RMSd moyen a été calculé sur l'ensemble des fragments protéiques correspondants dans la base de données. Celui des mots structuraux a été effectué préalablement. Le tableau 5.1 récapitule les mots observés et les RMSds associés. Dans une seconde étape, nous avons regardé s'il n'était pas possible dans ces mots de discerner des sous-familles structurales, cad des repliements distincts, mais associés aux mêmes successions de BPs.



 

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