Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire


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Calcul de l'entropie des distributions des blocs protéiques

Chaque site de la protéine hybride est défini par une loi de probabilité des blocs. Une entropie Hi peut donc être calculée pour quantifier la diversité des blocs en chaque site :


\begin{displaymath}H_i = - \sum_{b=1}^{16} f_i(b).ln[f_i(b)]\end{displaymath}

avec i la position du site, b un type de blocs protéiques et fi sa distribution correspondante. Ainsi, une entropie faible correspond à un site avec peu de blocs hautement probables et donc hautement déterminés.



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