Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire

   
Modèles protéiques

Les structures secondaires donnent une idée de la topologie de la protéine. Il convient néanmoins d'utiliser d'autres techniques pour aboutir à la structure réelle de la protéine. Deux types de techniques existent: celles qui se basent sur l'utilisation de fragments ou de séquences protéiques connus, pour la modélisation par homologie et pour l'enfilage (ou threading) et celles qui se basent sur une représentation simplifiée des acides aminés pour la modélisation ab initio.

• Modélisation par homologie
• Technique d'enfilage (ou threading)
• Modélisation ab initio
• Quelques exemples de prédiction jouant un rôle important dans le repliement protéique
  • chaînes latérales.
  • accessibilité.
  • contacts.