Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire
Les différentes méthodes d'analyse de la structure protéique montrent l'intérêt des structures secondaires, alphabet structural simple. Les progrès dans leur prédiction sont plus que prometteurs. Toutefois, même en supposant qu'ils puissent être parfaits, ils ne sont qu'un premier pas dans l'établissement d'une structure protéique 3D. En plus de l'analyse classique des boucles, les alphabets structuraux sont un outil précieux d'analyse pour comprendre l'architecture protéique et la répartition des acides aminés.
Les alphabets structuraux récents montrent de constants progrès et leur plus grande finesse, liée à la fois à un contrôle du nombre de blocs structuraux en jeu et à des méthodes d'obtention plus complexe. Toutefois des améliorations restent à faire, pour aboutir à un juste compromis entre une méthode d'obtention de prototypes structuraux simples utilisables dans une méthode de prédiction efficace qui permettent, en outre, une compréhension des différents acides aminés impliqués.
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