Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire
La méthode d'apprentissage que nous avons utilisée possède une certaine similitude avec celle de Schuchhardt et collaborateurs [175]. Il s'agit d'une méthode d'apprentissage proche des cartes auto-organisées de Kohonen [109].
Seront développés ici le type d'information prise en compte, avec la base de données et le codage des protéines en fonction des angles dièdres, la fonction de similitude entre deux fragments (pour savoir s'ils sont proches ou non), les deux étapes de la méthode d'apprentissage (non supervisée puis tenant compte des transitions) et enfin les critères permettant l'obtention d'un nombre différent de blocs protéiques pour chaque série.
(c) 2001- Alexandre de Brevern