Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire


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Description des blocs protéiques

La figure 3.5 montre le résultat de l'étape d'apprentissage avec les angles des 16 blocs. Le tableau 3.1 regroupe leurs valeurs exactes.


 \begin{sidewaystable}% latex2html id marker 1174
\centering
\begin{tabular}{c r ...
...ant les 16 blocs
prot\'eiques obtenus (not\'es en degr\'es).}\end{sidewaystable}

La figure 3.6 (visualisé avec le logiciel rasmol et sur la page de garde avec MOLSCRIPT [111]) montre pour chacun des 16 blocs protéiques, numérotés de a à p, des fragments superposés qui donnent ainsi une idée du type de repliement associé à chaque bloc. Les blocs ont été re-ordonnés suivant leurs fréquences de transition ainsi qu'en observant leur répartition dans les structures secondaires définies par la méthode de consensus [31]. Ces informations sont résumées dans le tableau 3.3.


  
Figure 3.5: Angles des 16 Blocs Protéiques obtenus (en degrés).
\begin{figure}
\centerline{\epsfxsize=15cm
\rotatebox{270}{\epsfbox{Images/Chapitre_3_PBs/Angles_PBsfr.ps}}}
\end{figure}


  
Figure 3.6: Superposition de fragments pour les 16 blocs protéiques.
\begin{figure}
\centerline{\epsfxsize=15cm
\rotatebox{0}{\epsfbox{Images/Chapitre_3_PBs/Superposition_3D_PBs-version2.ps}}}
\par\end{figure}




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