Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire

Analyse des matrices d'occurrences des blocs

Pour analyser les spécificités des répartions des acides aminés suivant le type de bloc impliqué, il est possible :

-

de quantifier la spécificité de chaque position dans la fenêtre.

-

de déterminer quels acides aminés en quelles positions ont une distribution spécifique dans le bloc considéré.

• La mesure de divergence asymétrique de Kullback-Leibler (KLd)
• Z-scores