Alexandre de Brevern - Thèse de Bioinformatique Moléculaire

   
Les alphabets structuraux

• But
• Un nombre important de blocs protéiques pour une description fine de la structure protéique
  • Par une méthode d'aggrégation en deux étapes (Unger et al., 1989, 1993)
  • Pour une librairie de sous-structures (Prestrelski et al., 1992)
  • Par une Carte-auto organisée de Kohonen (Schuchhardt et al., 1996)
• Peu de blocs protéiques
  • Utilisation d'un regroupement hiérarchique (Rooman el al., 1990)
  • Utilisation d'un réseau de neurones (Fetrow et al., 1993, 1997)
  • Utilisation des Chaînes de Markov Cachées (Camproux et al., 1999)
• Une méthode d'apprentissage sur la séquence et la structure (Bystroff et Baker, 1998)
  • Récapitulatif des alphabets structuraux et conclusion